醫(yī)學(xué)AI有新突破,頂級(jí)期刊連放大招
???? 很久以前,人工智能(ArtificialIntelligence,AI)給人的感覺(jué)還像是科幻片里的故事,直到去年3月,Google旗下的DeepMind研發(fā)的圍棋AI,AlphaGo,戰(zhàn)勝了圍棋老將李世石,一夜之間AI的名聲火遍大街小巷,人們不管懂不懂AI、懂不懂圍棋,都對(duì)這個(gè)話題進(jìn)行了各種摻和。后來(lái),正在圍棋界還對(duì)它不能釋?xiě)阎H,它跑去玩起了電競(jìng),再后來(lái),它又說(shuō)要進(jìn)軍醫(yī)學(xué)了。
????此時(shí),我們才真正關(guān)心起它來(lái)。不看不知道,原來(lái),AI想學(xué)醫(yī)已經(jīng)想了30多年了!大概之前還沒(méi)有太好的成績(jī),至少?zèng)]有“威脅”到醫(yī)生的存在,所以在我們普通醫(yī)生眼里都只是小透明吧。然而這段時(shí)間大AI們的各種活動(dòng)又頻繁起來(lái),除了AlphaGo的升級(jí)版Master又去圍棋圈攪個(gè)血雨腥風(fēng),醫(yī)學(xué)界也頻頻出現(xiàn)它們的身影。去年底到今年初短短三個(gè)月內(nèi),就連續(xù)有好幾篇新的研究發(fā)表在醫(yī)學(xué)頂級(jí)刊物上;尤其是Nature今年1月剛剛增設(shè)的子刊NatureBiomedicalEngineering,一上來(lái)就連放三篇人工智能研究,相當(dāng)驚艷。
????JAMA:糖尿病視網(wǎng)膜病變的高靈敏、高特異診斷
????AI的“深度學(xué)習(xí)”技術(shù),包含一系列的算法,使程序能夠自己通過(guò)對(duì)一個(gè)龐大的樣本數(shù)據(jù)集進(jìn)行學(xué)習(xí)、優(yōu)化自身,來(lái)實(shí)現(xiàn)某種行為。這份JAMA上的研究采用的算法是深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(convolutionalneuralnetwork,CNN),用來(lái)進(jìn)行圖像識(shí)別與分類(lèi)。
????研究者用128,175張視網(wǎng)膜照片作為訓(xùn)練數(shù)據(jù)庫(kù),讓AI學(xué)會(huì)自動(dòng)檢測(cè)糖尿病視網(wǎng)膜病變和視網(wǎng)膜黃斑水腫。這將近13萬(wàn)張圖片是由54名美國(guó)證認(rèn)的眼科專(zhuān)家和高級(jí)眼科住院醫(yī)師進(jìn)行分類(lèi)與分級(jí)。
????經(jīng)過(guò)8個(gè)月學(xué)習(xí)期,研究者讓AI分別在2個(gè)新的數(shù)據(jù)庫(kù)中驗(yàn)證它的兩個(gè)操作點(diǎn),一個(gè)操作點(diǎn)做高特異性選擇,另一個(gè)做度靈敏度選擇。新的數(shù)據(jù)庫(kù)分別為EyePACS-1和Messidor-2,來(lái)自?xún)蓚€(gè)眼科臨床機(jī)構(gòu),包含9963和4997張視網(wǎng)膜照片,并由至少7位眼科專(zhuān)家進(jìn)行分類(lèi)與評(píng)級(jí)。對(duì)數(shù)據(jù)集EyePACS-1,AI的高特異性操作點(diǎn)識(shí)別的靈敏度達(dá)到90.3%,特異性達(dá)到98.1%;對(duì)Messidor-2,AI識(shí)別的靈敏度有87.0%,特異性有98.5%。用AI的第2個(gè)操作點(diǎn)即高靈敏度操作點(diǎn)識(shí)別,對(duì)EyePACS-1的靈敏度有97.5%,特異性有93.4%;對(duì)Messidor-2的靈敏度有96.1%,特異性有93.9%。
????EyePACS-1數(shù)據(jù)集中AI的靈敏度和特異性曲線。8個(gè)圓點(diǎn)代表8位眼科專(zhuān)家,兩個(gè)棱形分別代表AI的高特異性操作點(diǎn)和高靈敏度操作點(diǎn)。
????這份研究是去年12月發(fā)表,表明AI的圖像識(shí)別功底已經(jīng)有了很了不起的特異性和靈敏度,跟人類(lèi)眼科專(zhuān)家不相上下。不過(guò)研究者也說(shuō)了,它的臨床應(yīng)用還有待進(jìn)一步評(píng)估。對(duì)了,本研究也是由Google公司領(lǐng)導(dǎo),與美國(guó)、印度多個(gè)知名研究機(jī)構(gòu)合作進(jìn)行。
????Nature:開(kāi)啟皮膚癌的智能手機(jī)篩查
????皮膚癌的診斷,通常是靠醫(yī)生的視診發(fā)現(xiàn)可疑病變,再進(jìn)一步通過(guò)皮膚鏡、活檢等手段確定。但皮膚紋理如此細(xì)密而變化多端,也給視診增加了難度。所以,這份來(lái)自斯坦福大學(xué)的研究也采用了深度CNN算法,來(lái)對(duì)皮膚圖像進(jìn)行識(shí)別。
????它之所以能登上當(dāng)期Nature的封面,想必是由于它宏偉壯麗。第一是想法有魄力,他們不僅是幫助醫(yī)生診斷,簡(jiǎn)直是踢館——要讓人們用智能手機(jī)就可以進(jìn)行皮膚惡性病變的篩查。第二是數(shù)據(jù)量很暴力,之前的皮膚AI研究都要依靠專(zhuān)業(yè)圖像,如皮膚鏡圖像或病理活檢圖像,不易獲得,所以數(shù)據(jù)量比較小,最后訓(xùn)練出來(lái)的小AI們放到真實(shí)的臨床環(huán)境中效率就不高;但要用手機(jī)拍照的圖片訓(xùn)練又會(huì)受到縮放、角度、光線等因素的影響,恐怕一樣效率不高,怎么破?
????本研究先用目前世界上最大的開(kāi)源圖像識(shí)別數(shù)據(jù)庫(kù)ImageNet中的128萬(wàn)張圖片進(jìn)行預(yù)訓(xùn)練,再用自己的129,450張圖片的數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行調(diào)諧,其中包括3,374張皮膚鏡圖像。第三是技術(shù)(說(shuō)起來(lái))很簡(jiǎn)單,前人的研究都有許多預(yù)處理步驟,如病變分層、提取特定表現(xiàn)的視覺(jué)特征等,但本AI的訓(xùn)練是“端對(duì)端(end-to-end)”的,只有原始像素和圖像標(biāo)簽,用單一網(wǎng)絡(luò)同時(shí)對(duì)付普通照片和皮膚鏡圖像。
????最后在新的圖片數(shù)據(jù)集中進(jìn)行驗(yàn)證,這些圖片都事先以活檢來(lái)確認(rèn)過(guò)。本AI與至少21位皮膚專(zhuān)家的診斷進(jìn)行兩場(chǎng)比拼。第一場(chǎng),是鑒別角化細(xì)胞癌與良性脂溢性角化病,即識(shí)別最常見(jiàn)的癌變。第二場(chǎng),是鑒別惡性黑色素瘤和良性的痣,即識(shí)別最致命的癌變。
????三幅圖分別為角化癌照片、黑色素瘤的照片以及黑色素瘤的皮膚鏡圖像識(shí)別。曲線是AI對(duì)病變識(shí)別的靈敏度-特異性曲線,每個(gè)圓點(diǎn)代表一位專(zhuān)家的識(shí)別,綠點(diǎn)是專(zhuān)家們的平均值,綠色誤差線是標(biāo)準(zhǔn)差。
????可以看到,大多數(shù)圓點(diǎn)都在藍(lán)色曲線以下,平均值也是。說(shuō)明專(zhuān)家們判斷的特異性和靈敏度都輸給了AI。
????乍一看,這個(gè)研究確實(shí)像踢館。不過(guò)仔細(xì)一想,確診是離不開(kāi)活檢的,還有其他臨床信息,而照片識(shí)別只是初篩。預(yù)計(jì)到2021年就會(huì)有63億臺(tái)智能手機(jī)裝上這樣的App,為大家進(jìn)行皮膚癌的早期篩查了。
????NatureBiomedicalEngineering:罕見(jiàn)病的診療建議及監(jiān)控
????上一篇研究提到,數(shù)據(jù)量越大,訓(xùn)練出來(lái)的AI就越準(zhǔn)確。那么罕見(jiàn)病怎么辦?原本就沒(méi)有這么多病例,是不是可以退出江湖了?中山大學(xué)的研究者證明給你看,少量數(shù)據(jù)不僅一樣可以達(dá)到很高的識(shí)別準(zhǔn)確度,還可以進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)分層、給出治療建議,而且已經(jīng)進(jìn)入臨床試驗(yàn)了!
????又是CNN算法,這回是識(shí)別先天性白內(nèi)障(CongenitalCataract,CC),人群中發(fā)病率只有1%,還多出現(xiàn)于欠發(fā)達(dá)地區(qū),醫(yī)療資源相對(duì)匱乏,于是需要更高效的監(jiān)控。
????這位AI寶寶是有名字的,叫CC-Cruiser,即CC巡洋艦。它的訓(xùn)練數(shù)據(jù)庫(kù)包括帶有診斷標(biāo)記的410張各種嚴(yán)重程度的CC圖片和476張正常圖片,那410張CC圖片又各自帶有嚴(yán)重程度標(biāo)記(晶體混濁面積、密度、位置)和治療建議(手術(shù)或隨訪)標(biāo)記,就這么低調(diào)華麗有內(nèi)涵。
????之后進(jìn)行了多項(xiàng)驗(yàn)試。包括電腦模擬測(cè)試(insilicotest)、57例臨床樣本的臨床試驗(yàn)、53例樣本的網(wǎng)絡(luò)圖片測(cè)試,CC-Cruiser的表現(xiàn)都很令人滿(mǎn)意。以人類(lèi)專(zhuān)家意見(jiàn)為參考,對(duì)前兩者的診斷準(zhǔn)確率都在98%左右,網(wǎng)絡(luò)圖片質(zhì)量參差不齊,但也達(dá)到了92.45%;對(duì)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估、診斷建議的判斷也同樣出色。接下來(lái)是有趣的“大海撈針試驗(yàn)”,模擬CC的發(fā)病率,混淆100張正常圖片和1張CC圖片讓它識(shí)別,連測(cè)3組,CC-Cruiser都全部通關(guān)。最后在跟人類(lèi)眼科醫(yī)生的比拼中,不出意料地贏了。
????這么優(yōu)秀的AI,給它發(fā)個(gè)規(guī)培證吧~研究者建立了一個(gè)云平臺(tái),來(lái)幫助非專(zhuān)科醫(yī)院進(jìn)行診療。
????地方醫(yī)院里來(lái)了一位患者,他的人口學(xué)信息、聯(lián)系方式連同眼科檢查資料都一起上傳到CC-Cruiser處理器和云平臺(tái),讓它進(jìn)行診斷、風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估并給出治療建議。如果建是手術(shù),則同時(shí)給中國(guó)衛(wèi)生部?jī)和變?nèi)障計(jì)劃(CCPMOH)的專(zhuān)家發(fā)送提示進(jìn)行人工確認(rèn),專(zhuān)家和地方醫(yī)院、患者進(jìn)行溝通,制定治療計(jì)劃。
????NatureBiomedicalEngineering:腦瘤的術(shù)中快速診斷
????圖像識(shí)別除了CNN,還有別的算法。在一項(xiàng)關(guān)于腦瘤術(shù)中快速診斷的研究中,研究者用采一項(xiàng)叫受激拉曼散射顯微鏡(stimulatedRamanscattering,SRS)的技術(shù),生成高度模擬傳統(tǒng)的HE染色病理切片的新圖像,稱(chēng)之為受激拉曼組織學(xué)(stimulatedRamanhistology,SRH)圖像。病理醫(yī)生對(duì)SRH圖像和傳統(tǒng)HE圖像做了比較,確認(rèn)了SRH的診斷作用。
????AI在這個(gè)研究中并不是主角,而是錦上添花。雖然SRS比傳統(tǒng)的病理切片節(jié)省了很多組織樣本預(yù)處理的時(shí)間,大大提高了術(shù)中診斷的速度,但研究者仍嫌病理醫(yī)生人手不夠,希望用AI來(lái)服務(wù)大眾。
????這回采用的算法叫多層感知機(jī)(MultilayerPerceptron,MLP),更適應(yīng)目前常用的計(jì)算機(jī)的處理能力。研究者用來(lái)自101名患者的12,897張SRH高倍視野圖片建立訓(xùn)練庫(kù),同時(shí)也加入了一個(gè)外部的開(kāi)源圖像數(shù)據(jù)庫(kù)WND-CHRM的2,919張圖片,讓MLP進(jìn)行迭代,直到診斷的預(yù)測(cè)值和觀察值差距最小。
????MLP根據(jù)神外醫(yī)生做出決策的需要,對(duì)圖像進(jìn)行四種分類(lèi):非病變組織、低級(jí)別膠質(zhì)瘤、高級(jí)別膠質(zhì)瘤和非膠質(zhì)腫瘤(包括轉(zhuǎn)移瘤、腦膜瘤、淋巴瘤和成神經(jīng)管細(xì)胞瘤)。用了30個(gè)案例對(duì)MLP進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果它在樣本層面能做到100%區(qū)分病變和非病變;對(duì)單個(gè)顯微視野的識(shí)別則能達(dá)到94.1%的特異性和94.5%的靈敏度。在病變樣本中,MLP能以90%的準(zhǔn)確率區(qū)分膠質(zhì)瘤和非膠質(zhì)瘤。
????a,MLP對(duì)30個(gè)樣本的病變與非病變鑒別;b,MLP對(duì)膠質(zhì)瘤和非膠質(zhì)瘤的鑒別;c,MLP對(duì)30個(gè)樣本進(jìn)行4種分類(lèi)的總體情況。NL,非病變;LG,低級(jí)別膠質(zhì)瘤;HGG,高級(jí)別膠質(zhì)瘤;NG,非膠質(zhì)腫瘤。
????研究者稱(chēng),這個(gè)結(jié)果已可以滿(mǎn)意了,AI可以幫助病理醫(yī)生進(jìn)行術(shù)中快速診斷,并彌補(bǔ)醫(yī)生的個(gè)體水平差距,但將來(lái)還要研發(fā)更準(zhǔn)確、更細(xì)化的方法。
????NatureBiomedicalEngineering:神經(jīng)假體的精確控制
????前面的研究都是在診斷上下功夫,最多給出治療建議,但它能切實(shí)地進(jìn)行治療,改善病情嗎?這項(xiàng)來(lái)自倫敦帝國(guó)理工學(xué)院的研究就是一個(gè)成功的探索。
????被截肢的患者裝了假肢,如何恢復(fù)自主運(yùn)動(dòng)功能?靶向肌肉神經(jīng)移植術(shù)(targetedmusclereinnervation,TMR)是本領(lǐng)域的一個(gè)突破,例如將正中神經(jīng)接到肱二頭肌長(zhǎng)頭。之后需要檢測(cè)相關(guān)肌肉神經(jīng)的電活動(dòng)信息,來(lái)實(shí)現(xiàn)患者對(duì)假肢的控制。
????傳統(tǒng)的做法是用兩個(gè)電極檢測(cè)整個(gè)肌肉(或肌群)的電活動(dòng),但由于位置太模糊,容易跟鄰近肌肉的信息發(fā)生交叉,不容易做到精確控制。本研究則使用了至少50個(gè)更小的電極緊密排布,使得檢測(cè)到的信息更為細(xì)致豐富,可獲得單個(gè)神經(jīng)元的電活動(dòng)信息,并使用一種叫支持向量機(jī)(supportvectormachine,SVM)的機(jī)器學(xué)習(xí)算法來(lái)處理,與傳統(tǒng)方法比較,精確度有很大的提高(97%VS85%)。
????a,上圖:傳統(tǒng)方法用兩個(gè)電極記錄肌電信號(hào)。下圖:高密度肌電系統(tǒng)使得AI能夠識(shí)別單個(gè)運(yùn)動(dòng)單元及其放電率。b,c,示例盂肱關(guān)節(jié)截肢并TMR術(shù)后患者,用高密度肌電圖解碼神經(jīng)驅(qū)動(dòng)(b,虛線區(qū)為神經(jīng)移植區(qū)域)。給予3個(gè)電極陣列來(lái)收信肌電信號(hào)(c)
????不過(guò)從圖上看,很顯然這么個(gè)龐然大物攜帶起來(lái)肯定不方便。但這至少提供了一種思路,研究者也會(huì)在將來(lái)尋找更好的設(shè)備,或開(kāi)發(fā)新的方法來(lái)解決。
????原文:Man/machineinterfacebasedonthedischargetimingsofspinalmotorneuronsaftertargetedmusclereinnervation
????如此看來(lái),AI在醫(yī)學(xué)圈的事業(yè)好像終于起飛了呢。
????近日又聽(tīng)到圍棋圈傳出4月要進(jìn)行人機(jī)大戰(zhàn)第二季的消息,這回對(duì)擂雙方是AlphaGo和柯潔??聺嵰呀?jīng)算是圍棋界百年一遇的奇才了,但現(xiàn)在連對(duì)戰(zhàn)國(guó)產(chǎn)圍棋AI“絕藝”都有些吃力,人工智能的發(fā)展確實(shí)令人震驚。而且,聽(tīng)說(shuō)這回是AlphaGo在圍棋界的最后一戰(zhàn),之后大概就潛心學(xué)醫(yī)了吧。
????至于那些“AI要替代醫(yī)生、我們的存在還有沒(méi)有意義”之類(lèi)的言論,向來(lái)心大的麥子覺(jué)得,我們發(fā)明的一切東西難道不都是為我們所用的嗎?況且,還有小型研究要研發(fā)寫(xiě)病理報(bào)告的AI,給病理醫(yī)師騰出認(rèn)真讀片的時(shí)間呢(Arch.Pathol.Lab.Med.(2015)139,929–935.),說(shuō)不定很快臨床醫(yī)生就有病歷AI、科研人員就有論文AI了。